ABSTRACT: The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.

RESUMO: Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.

Abstract Worm infections pose a significant challenge to goat farming in the tropics. While individual variations in the animals' response to this disease are observed, understanding its genetic component is crucial for establishing effective herd production management, prioritizing the selection of goats with higher resistance to parasitism. This study aimed to assess goat response to worm infection under natural field conditions using data on eggs per gram of feces (EPG), body condition score (BCS), and conjunctival mucosa coloration (FAMACHA©). Cluster analysis and artificial intelligence (AI) techniques were applied to 3,839 data points from 200 individuals in an experimental goat herd in Piauí, Brazil. The study considered the phenotypic expression of resistance, sensitivity, and resilience to worm infection as responses to parasitism. Three clustering methods, namely Ward, Average, and k-means, were employed and compared with fuzzy logic obtained through the CAPRIOVI web software. The analysis revealed statistically significant differences (P<0.05) between the groups of animals classified as resistant, resilient, and sensitive to parasitism. Pregnancy and peripartum were identified as stages of heightened sensitivity to parasitism (P<0.05). Among the clustering techniques, traditional statistical methods exhibited excellent performance, with an overall accuracy percentage exceeding 90.00%. In contrast, CAPRIOVI's fuzzy logic demonstrated lower overall accuracy (77.00%). The clustering methods showed similar efficiency, but differed in terms of the distribution of animals per group, with a tendency towards greater numbers in the resistant category. Fuzzy logic circumvented this limitation by enabling the formation of groups tailored to meet the producer's interests, adding consistency in terms of the animals' response to worm infection. This finding highlights the potential of the software for goat health management.

Resumo A incidência de verminose é um dos principais obstáculos para a caprinocultura nos trópicos. A variação individual da resposta do animal à enfermidade existe, mas precisa ser determinado o seu componente genético e estabelecer o manejo zootécnico dos rebanhos, priorizando a seleção de animais mais resistente ao parasitismo. Objetivou-se nesse estudo avaliar a resposta de cabras à incidência de verminose sob condições de infecção natural a campo, com informações de ovos por grama de fezes (OPG), escore da condição corporal (ECC) e grau de coloração da mucosa conjuntiva (FAMACHA©), recorrendo a utilização de análise de agrupamento e a aplicação de inteligência artificial (IA). Foram utilizadas 3.839 informações de 200 indivíduos em um rebanho experimental de caprinos no Piauí. Considerou-se como resposta ao parasitismo a expressão fenotípica de resistência, sensibilidade e resiliência a verminose, submetidos a três métodos de agrupamento: Ward, Average e K-means, comparado com a lógica Fuzzy, obtidos com o software web CAPRIOVI. Os resultados demonstraram que os grupos de animais resistente, resiliente e sensível ao parasitismo foram estatisticamente distintos (P<0,05). As cabras durante a gestação e o periparto foram identificadas como fases de maior sensibilidade ao parasitismo (P<0,05). O CAPRIOVI aplica a lógica Fuzzy e apresentou o menor percentual de acerto global (77,00%), enquanto os métodos estatísticos tradicionais se destacaram com percentual de acerto global superior a 90,00%, demonstrando excelência estatística com esse fim. Os métodos de agrupamentos apresentaram semelhança na eficiência, mas diferiram quanto à distribuição de animais por agrupamento, com tendência de maior quantidade na categoria resistente. A aplicação da lógica Fuzzy contornou essa limitação ao direcionar a formação dos grupos visando atender o interesse do produtor, inserindo consistência em termos de resposta dos animais a verminose, qualificando o software com potencial para adequação ao manejo sanitário de caprinos.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi caracterizar fenotipicamente caprinos crioulos das raças Moxotó, Azul, Canindé, Repartida, Marota e Graúna, em comparação às raças exóticas Boer, Anglo Nubiana e Alpina, para identificar grupos genéticos de maior potencial para qualidade de carcaça e resistência à verminose. Dados de medidas morfométricas foram obtidos quanto à contagem de ovos de vermes por grama de fezes (OVGF), ao escore Famacha, às medidas de carcaça e ao peso corporal de 308 animais de uma fazenda no Estado do Piauí. Os caprinos Repartida apresentaram a maior média de altura de cernelha (61,55 cm) e altura de garupa (62,16 cm), e os caprinos Moxotó, o maior comprimento de orelha (13,45 cm). A raça Moxotó apresentou as maiores médias de carcaça e peso corporal. O menor peso corporal médio foi dos caprinos Azul (24,35 kg), e o menor valor de OVGF foi o dos caprinos Repartida (200 ovos por grama de fezes). Para o escore Famacha, a média foi 2,77. O método da ligação média foi o que melhor resumiu a informação dos dados morfométricos e de carcaça. O uso de medidas morfométricas e de carcaça apresentou resultados satisfatórios na caracterização fenotípica dos animais. Os caprinos crioulos, considerados resistentes à verminose e com características de carcaça de boa qualidade, poderão ser indicados para programas de conservação e melhoramento genético.

Abstract: The objective of this work was to phenotypically characterize creole goats of the Moxotó, Azul, Canindé, Repartida, Marota, and Graúna breeds, comparing them with the Boer, Anglo Nubian, and Alpine exotic breeds, to identify the genetic groups of greater potential for carcass quality and resistance to infection caused by worm. Data on morphometric measurements were obtained for the count of worm eggs in grams of feces (WEGF), Famacha score, carcass measurements, and body weight from 308 animals, in a farm in the state of Piauí, Brazil. Repartida goats showed the highest average for wither height (61.55 cm) and rump height (62.16 cm), and Moxotó goats had the greatest ear length (13.45 cm). The Moxotó breed showed the highest means for carcass and body weight. The lowest average for body weight was observed in Azul goats (24.35 kg), and the lowest WEGF was detected in Repartida goats (200 eggs per gram of feces). The average Famacha score was 2.77. Average linkage was the method that best summarized the information on the morphometric and carcass data. The use of morphometric and carcass measurements provides satisfactory results in the phenotypic characterization of the animals. The Brazilian creole goats, which are considered resistant to worm infection and show high-quality carcass traits, may be indicated for conservation and genetic breeding programs.

RESUMO Contexto: Estudos epidemiológicos demonstram, por razões desconhecidas, o predomínio dos casos de apendicite no verão e em adultos jovens do sexo masculino, havendo controvérsias sobre sua associação com o período chuvoso. Não há estudos realizados no Piauí sobre esta associação. Objetivo: Estabelecer uma associação entre a ocorrência de apendicite e o índice de precipitação pluviométrica. Metodologia: Realizou-se um estudo transversal através do banco de dados do serviço de patologia de um hospital de emergência público do Piauí e do índice de precipitação no Piauí de janeiro de 2009 a abril de 2014 do Instituto Nacional de Meteorologia. Aplicou-se estatística descritiva e medidas de associação pelo coeficiente de correlação de Pearson e pelo teste qui-quadrado. Resultados: Encontrou-se um predomínio dos casos de apendicite no sexo masculino, de 11 a 20 anos de idade, predomínio da média mensal de casos de apendicite no segundo semestre, coincidindo com o período de estiagem no Piauí. O coeficiente de correlação de Pearson foi de -0,260. Conclusão: Existe uma associação da ocorrência de apendicite com os meses do ano, porém se trata de uma fraca correlação negativa entre a média mensal de casos de apendicite com a média da precipitação pluviométrica mensal estadual no Piauí.

ABSTRACT Background: Epidemiological studies demonstrate, for unknown reasons, the prevalence of appendicitis in the summer and in young male adults, and there are controversies about its association with the rainy season. There are no studies in the State of Piauí about such association. Objective: To establish an association between the occurrence of appendicitis and the pluviometric precipitation index. Methodology: This is a cross-sectional study that was carried out using the database of the pathology service at a public emergency hospital in Piauí, and the pluviometric precipitation index in the State of Piauí from January 2009 to April 2014, with data from the National Institute of Meteorology. Descriptive statistics and association measures were applied using the Pearson correlation coefficient and the χ 2 test. Results: We found a predominance of appendicitis cases in male subjects, from 11 to 20 years of age, with a predominance of the monthly mean of appendicitis cases in the second semester, which conforms to the dry season in the State of Piauí. Pearson's correlation coefficient was −0.260. Conclusion: There is an association between the occurrence of appendicitis and the months of the year; however, this is a weak negative correlation between the monthly mean of cases of appendicitis and monthly pluviometric precipitation average in the State of Piauí.